堆肥發(fā)酵過程較為簡單，一共分為兩個階段，即前期主發(fā)酵階段和后發(fā)酵階段。

　　1、主發(fā)酵階段（一次發(fā)酵）

　　主發(fā)酵階段可在露天或發(fā)酵裝置內(nèi)進行，通過翻推或強制通風向堆積層或發(fā)酵裝置內(nèi)供給氧氣。在露天堆肥或發(fā)酵裝置內(nèi)堆肥時，由于原料和土壤中存在的微生物作用而開始發(fā)酵。

　　首先是易分解物質(zhì)分解，產(chǎn)生C02和H20，同時產(chǎn)生熱量，使堆溫上升，這些微生物吸取有機物的碳氮營養(yǎng)成分。在細菌自身繁殖的同時，將細胞中吸收的物質(zhì)分解而產(chǎn)生熱量。

　　發(fā)酵初期物質(zhì)的分解發(fā)酵作用是靠中溫菌(30～40℃是為最適宜生長溫度)進行的，隨著堆溫上升，最適宜溫度45～65℃的高溫菌取代了中溫菌。在此溫度下，各種病原菌均可被殺死。一般將溫度升高到開始降低為止的階段稱為主發(fā)酵階段，以生活垃圾為主體的城市垃圾及家畜糞尿好氧堆肥，主發(fā)酵期約為3～10天。

　　2、后發(fā)酵階段（二次發(fā)酵）

　　經(jīng)過主發(fā)酵的半成品被送到后發(fā)酵工序，將主發(fā)酵工序尚未分解的易分解有機物和較難分解的有機物進一步分解，使之變成腐殖酸、氨基酸等比較穩(wěn)定的有機物，得到完全成熟的堆肥制品。一般把物料堆積到1～2m高，進行后發(fā)酵，并要有防止雨水流入的裝置。有的場合還需要翻堆和通風，通常不進行通風，而是每周進行一次翻堆。

　　發(fā)酵時間的長短，決定于堆肥的使用情況。例如，堆肥用于溫床(能夠利用堆肥的分解熱)時，可在主發(fā)酵后直接使用；對幾個月不種作物的土地，大部分可以不進行后發(fā)酵而直接施用堆肥。
　　對一直在種作物的土地，則需要使堆肥進行到不能發(fā)生奪取土壤氮的程度，后發(fā)酵時間通常在20～30天以上。
　　在此，推薦大家使用人元生物公司生產(chǎn)的“有機肥發(fā)酵劑”，在使用發(fā)酵劑的情況下，可以使堆肥發(fā)酵周期大大縮短，一般24小時內(nèi)即可達到理想的發(fā)酵溫度（60-70℃），10-20天即可發(fā)酵完成，發(fā)酵效率提高了3倍，在提高發(fā)酵效率的同時還降低了發(fā)酵成本，適合堆肥發(fā)酵批量循環(huán)作業(yè)。